Trường hợp 2: Kiểm tra sau hoàn thuế tại trụ sở người nộp thuế được thực hiện trong thời hạn bao lâu?

Theo khoản 3 Điều 22 Luật Quản lý thuế 2025, kiểm tra sau hoàn thuế tại trụ sở người nộp thuế áp dụng với hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước theo nguyên tắc quản lý rủi ro, và việc kiểm tra phải được thực hiện trong thời hạn 05 năm kể từ ngày ban hành quyết định hoàn thuế. Điều này có nghĩa là dù doanh nghiệp đã được hoàn thuế, cơ quan thuế vẫn có thể đến kiểm tra tại trụ sở trong vòng 5 năm để xác minh tính chính xác, hợp pháp của số thuế đã hoàn. Doanh nghiệp cần lưu trữ hồ sơ hoàn thuế tối thiểu 5 năm kể từ ngày nhận quyết định hoàn.