Câu Hỏi Thường Gặp

Kho ngoại quan và chế độ thuế tháng 4/2026 theo Nghị định 68/2016/NĐ-CP về kho ngoại quan và Luật Hải quan 2014: (1) Hàng hóa gửi vào kho ngoại quan: Chưa phải nộp thuế nhập khẩu, thuế GTGT nhập khẩu – được xem là hàng chưa nhập vào lãnh thổ Việt Nam; (2) Thời gian lưu kho ngoại quan: Tối đa 12 tháng, có thể gia hạn thêm; (3) Khi đưa ra ngoại quan vào nội địa: Phải làm thủ tục nhập khẩu và nộp đủ các loại thuế; (4) Khi tái xuất sang nước thứ ba hoặc gửi vào KCX: Không phải nộp thuế nhập khẩu, không phải nộp thuế GTGT; (5) Phí lưu kho ngoại quan: Do chủ kho thu theo thỏa thuận; (6) Kiểm tra hải quan: Hải quan giám sát thường xuyên hàng hóa trong kho ngoại quan, mọi sự dịch chuyển phải thông báo hải quan. Tháng 4/2026, doanh nghiệp FDI có thể dùng kho ngoại quan để lưu hàng tạm thời khi chưa xác định được thị trường đầu ra.

Theo Luật thuế TNDN và Nghị định 13/2019/NĐ-CP về doanh nghiệp KH&CN, ưu đãi thuế TNDN áp dụng như sau: (1) Thuế suất ưu đãi 10% trong 15 năm kể từ năm đầu tiên có doanh thu từ hoạt động KH&CN; (2) Miễn thuế 4 năm đầu và giảm 50% thuế trong 9 năm tiếp theo; (3) Ưu đãi chỉ áp dụng cho phần doanh thu từ hoạt động KH&CN (tối thiểu 30% tổng doanh thu để được công nhận là doanh nghiệp KH&CN). Tháng 4/2026, doanh nghiệp cần kiểm tra: Giấy chứng nhận doanh nghiệp KH&CN còn hiệu lực (cấp bởi Bộ KH&CN hoặc Sở KH&CN), tỷ lệ doanh thu từ hoạt động KH&CN trong năm 2025 có đạt tối thiểu 30% không, và hoàn thiện hồ sơ chứng minh để kê khai ưu đãi tại phụ lục 03-3A/TNDN. Nếu không đáp ứng điều kiện trong năm 2025, doanh nghiệp phải nộp bổ sung phần thuế TNDN chênh lệch.

Thuế nhà thầu (Withholding Tax) khi doanh nghiệp FDI trả tiền bản quyền (royalty) cho công ty mẹ nước ngoài tháng 4/2026 theo Thông tư 103/2014/TT-BTC: (1) Thuế TNDN nhà thầu: 10% trên tổng tiền bản quyền trả cho bên nước ngoài; (2) Thuế GTGT nhà thầu: 5% nếu nhà thầu nước ngoài không đáp ứng điều kiện nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ; (3) Thời hạn kê khai và nộp: Trong vòng 10 ngày kể từ ngày phát sinh nghĩa vụ; (4) Hiệp định tránh đánh thuế hai lần (Tax Treaty): Nếu Việt Nam có hiệp định với nước của công ty mẹ, mức thuế bản quyền có thể giảm xuống 5-7.5% (ví dụ: Nhật Bản 10%, Hàn Quốc 5-15%, Hoa Kỳ 5-10% tùy loại). Để áp dụng thuế suất ưu đãi theo hiệp định, phải nộp Mẫu xác nhận cư trú thuế (Certificate of Residence) của công ty mẹ và Mẫu đề nghị áp dụng hiệp định. Tháng 4/2026, rà soát lại tất cả hợp đồng bản quyền, phí quản lý, phí dịch vụ với bên nước ngoài để đảm bảo kê khai đầy đủ.

Doanh nghiệp FDI bắt buộc kiểm toán độc lập báo cáo tài chính năm 2025 theo Nghị định 17/2012/NĐ-CP và Luật Kiểm toán độc lập 2011. Cơ quan nhận báo cáo và thời hạn: (1) Cơ quan thuế: Nộp cùng hồ sơ quyết toán thuế TNDN, chậm nhất 31/3/2026 (tháng 4/2026 nếu gia hạn); (2) Cơ quan đăng ký kinh doanh (Phòng ĐKKD – Sở KH&ĐT): Chậm nhất trong 30 ngày kể từ ngày ký báo cáo kiểm toán; (3) Cơ quan Thống kê: Theo Chế độ báo cáo thống kê quốc gia; (4) Ban Quản lý Khu công nghiệp (nếu doanh nghiệp trong KCN): Theo quy định của từng BQL. Công ty kiểm toán phải thuộc danh sách được Bộ Tài chính công bố đủ điều kiện kiểm toán. Doanh nghiệp FDI chưa nộp báo cáo kiểm toán tính đến tháng 4/2026 cần hoàn thiện ngay để tránh bị phạt từ 20–30 triệu đồng theo Nghị định 41/2018/NĐ-CP.

Thủ tục góp thêm vốn điều lệ từ công ty mẹ nước ngoài cho doanh nghiệp FDI tháng 4/2026: (1) Điều chỉnh Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư (IRC): Nộp hồ sơ tại Sở KH&ĐT hoặc Ban Quản lý KCN gồm văn bản đề nghị điều chỉnh, quyết định của nhà đầu tư, giải trình về nguồn vốn bổ sung, báo cáo tình hình thực hiện dự án đầu tư; (2) Điều chỉnh Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp (ERC): Nộp hồ sơ tại Phòng ĐKKD sau khi có IRC mới; (3) Thực hiện chuyển tiền: Qua tài khoản vốn đầu tư trực tiếp (DICA) tại ngân hàng được phép, kèm hồ sơ kiểm soát ngoại hối; (4) Thời gian xử lý: 10–15 ngày làm việc cho IRC, 3–5 ngày cho ERC; (5) Sau góp vốn: Cập nhật với cơ quan thuế, BHXH, và công bố thông tin trên Cổng thông tin quốc gia về đăng ký doanh nghiệp. Lưu ý: Vốn góp phải được chuyển vào tài khoản DICA trước khi hoàn tất thủ tục điều chỉnh.

Hiện tại không có quy định miễn BHXH hoàn toàn cho nhân sự nghiên cứu của doanh nghiệp KH&CN. Tuy nhiên, theo Luật BHXH 2024 (hiệu lực 01/7/2025) và các chính sách hỗ trợ KH&CN: (1) Nhân sự làm việc theo hợp đồng khoán việc, hợp đồng vụ việc dưới 3 tháng: Không bắt buộc tham gia BHXH bắt buộc (chỉ BHXH tự nguyện); (2) Chuyên gia nước ngoài làm việc tại VN: Bắt buộc tham gia BHXH từ 01/12/2018 (Nghị định 143/2018) nhưng được miễn một số chế độ; (3) Hỗ trợ gián tiếp: Chi phí đóng BHXH cho nhân sự R&D được tính vào chi phí được trừ khi tính thuế TNDN và có thể dùng từ Quỹ phát triển KH&CN; (4) Tháng 4/2026: Doanh nghiệp KH&CN nộp báo cáo sử dụng Quỹ KH&CN năm 2025 kèm hồ sơ quyết toán thuế TNDN. Nếu Quỹ KH&CN không sử dụng hết trong 5 năm phải nộp lại ngân sách cùng tiền phạt chậm nộp.

Doanh nghiệp FDI trong Khu chế xuất (KCX) bán hàng vào thị trường nội địa tháng 4/2026 theo Nghị định 82/2018/NĐ-CP và Thông tư 38/2015/TT-BTC: (1) Giao dịch KCX → Nội địa được xem là nhập khẩu từ nước ngoài vào Việt Nam; (2) Thủ tục: Doanh nghiệp nội địa (người mua) phải làm thủ tục nhập khẩu, nộp thuế nhập khẩu và thuế GTGT nhập khẩu tương ứng; (3) Doanh nghiệp KCX (người bán): Lập tờ khai hải quan xuất khẩu (loại hình E52 – xuất kinh doanh), xuất hóa đơn GTGT 0%; (4) Chứng từ: Hợp đồng mua bán, hóa đơn thương mại, packing list, tờ khai hải quan; (5) Giám sát hải quan: Hàng ra khỏi hàng rào KCX phải qua cổng kiểm soát hải quan và lưu tại bãi giám sát hải quan trước khi bàn giao. Doanh nghiệp KCX không được bán hàng nội địa mà không có tờ khai hải quan - đây là vi phạm nghiêm trọng pháp luật hải quan.

Doanh nghiệp FDI thường kê khai thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ (trực tiếp trên GTGT áp dụng cho DN doanh thu dưới 1 tỷ/năm). Hạn nộp tờ khai và nộp thuế GTGT tháng 4/2026: (1) Tờ khai thuế GTGT tháng 3/2026: Chậm nhất ngày 20/4/2026 (nếu khai theo tháng – áp dụng với DN có doanh thu > 50 tỷ/năm); (2) Tờ khai thuế GTGT quý I/2026: Chậm nhất ngày 30/4/2026 (nếu khai theo quý – áp dụng với DN có doanh thu ≤ 50 tỷ/năm); (3) Nộp thuế GTGT: Cùng thời hạn nộp tờ khai; (4) Khai bổ sung: Có thể nộp hồ sơ bổ sung trước khi cơ quan thuế thanh tra, kiểm tra. Doanh nghiệp FDI cần chú ý: Hóa đơn GTGT đầu vào phải được kê khai trong vòng 3 năm kể từ ngày lập (theo Luật Quản lý thuế 2019); đầu vào phục vụ hoạt động miễn thuế không được khấu trừ.

Thủ tục cấp Giấy phép lao động (GPLĐ) cho chuyên gia nước ngoài tháng 4/2026 theo Nghị định 70/2023/NĐ-CP: (1) Hồ sơ đề nghị cấp GPLĐ: Văn bản đề nghị của người sử dụng lao động, lý lịch tư pháp nước ngoài (hợp pháp hóa lãnh sự, chứng thực, dịch thuật), bằng cấp/chứng chỉ chuyên môn (tối thiểu 3 năm kinh nghiệm đối với chuyên gia), giấy khám sức khỏe, 2 ảnh 4x6; (2) Nơi nộp: Sở LĐ-TB&XH tỉnh/thành nơi người lao động nước ngoài dự kiến làm việc; (3) Thời gian giải quyết: Tối đa 5 ngày làm việc; (4) Thời hạn GPLĐ: Tối đa 2 năm, có thể gia hạn 2 lần; (5) Trước khi cấp GPLĐ: Phải có văn bản chấp thuận nhu cầu sử dụng lao động nước ngoài từ Sở LĐ-TB&XH (nộp trước ít nhất 30 ngày); (6) Miễn GPLĐ: Nhà quản lý, giám đốc điều hành, chuyên gia vào VN dưới 30 ngày/lần và không quá 3 lần/năm. Tháng 4/2026, rà soát GPLĐ của toàn bộ lao động nước ngoài sắp hết hạn để gia hạn kịp thời.

Báo cáo sử dụng Quỹ phát triển KH&CN năm 2025 của doanh nghiệp theo Thông tư 67/2022/TT-BTC: (1) Thời hạn nộp: Cùng với hồ sơ quyết toán thuế TNDN năm 2025, tức là đã qua hạn 31/3/2026 – tháng 4/2026 là thời điểm hoàn chỉnh hồ sơ bổ sung; (2) Nộp cho: Cơ quan thuế trực tiếp quản lý (Chi cục Thuế hoặc Cục Thuế); (3) Mẫu báo cáo: Mẫu số 02 ban hành kèm Thông tư 67/2022/TT-BTC – Báo cáo tình hình trích lập và sử dụng Quỹ KH&CN; (4) Nội dung: Số dư đầu kỳ, số trích lập trong năm (tối đa 10% thu nhập tính thuế), số sử dụng theo từng hạng mục (R&D, đào tạo nhân lực KH&CN, mua thiết bị), số dư cuối kỳ; (5) Lưu ý: Quỹ không sử dụng hết sau 5 năm kể từ năm trích lập phải nộp ngân sách nhà nước cùng tiền phạt chậm nộp 150%. Doanh nghiệp KH&CN nên lập kế hoạch sử dụng quỹ chi tiết để tránh mất ưu đãi.