Câu Hỏi Thường Gặp

Khi không đồng ý với kết luận hoặc quyết định xử lý thuế sau kiểm tra, doanh nghiệp có thể thực hiện các bước bảo vệ quyền lợi sau:
1. Phản bác biên bản kiểm tra: ghi ý kiến không đồng ý trực tiếp vào biên bản trước khi ký hoặc không ký nếu có lý do chính đáng.
2. Khiếu nại lần 1: gửi đơn khiếu nại đến Thủ trưởng cơ quan thuế đã ban hành quyết định trong thời hạn 30 ngày kể từ ngày nhận quyết định.
3. Khiếu nại lần 2: nếu không đồng ý với kết quả giải quyết khiếu nại lần 1, tiếp tục khiếu nại lên cơ quan thuế cấp trên.
4. Khởi kiện hành chính: khởi kiện ra Tòa án nhân dân có thẩm quyền nếu vẫn không đồng ý sau khiếu nại lần 2.
IAM hỗ trợ doanh nghiệp soạn hồ sơ khiếu nại và tư vấn chiến lược bảo vệ quyền lợi thuế.

Có liên quan chặt chẽ. Từ 01/07/2026, Luật Quản lý thuế 2025 đẩy mạnh quản lý thuế dựa trên dữ liệu số hóa. Cơ quan thuế có thể truy xuất dữ liệu hóa đơn điện tử trực tiếp từ hệ thống, đối chiếu với tờ khai thuế mà không cần đến trụ sở doanh nghiệp. Sự chênh lệch giữa dữ liệu hóa đơn điện tử và số liệu kê khai thuế là tín hiệu rủi ro có thể kích hoạt quyết định kiểm tra. Doanh nghiệp sử dụng phần mềm kế toán tích hợp hóa đơn điện tử (như IAM INVOICE) giúp đảm bảo dữ liệu đồng nhất, giảm thiểu rủi ro bị chọn kiểm tra. Từ 01/06/2025, không còn được hủy hóa đơn điện tử có sai sót theo Nghị định 70/2025/NĐ-CP.

IAM cung cấp gói dịch vụ hỗ trợ toàn diện giúp doanh nghiệp sẵn sàng trước đợt kiểm tra thuế tại trụ sở, gồm:
• Soát xét hồ sơ thuế (Tax Review): rà soát tờ khai, hóa đơn, sổ sách và chứng từ để phát hiện sai sót trước kiểm tra.
• Tư vấn kê khai điều chỉnh: hỗ trợ điều chỉnh tờ khai trước khi bị cơ quan thuế phát hiện nhằm giảm mức phạt.
• Chuẩn bị hồ sơ giải trình: xây dựng tài liệu giải trình logic, đầy đủ cơ sở pháp lý cho từng nghiệp vụ.
• Đồng hành trong kiểm tra: cử chuyên gia tham gia làm việc trực tiếp với đoàn kiểm tra tại doanh nghiệp.
• Hỗ trợ khiếu nại: soạn hồ sơ và tư vấn chiến lược khiếu nại nếu không đồng ý kết luận.
Liên hệ IAM để được tư vấn miễn phí về quản lý rủi ro thuế cho doanh nghiệp.

Có. Doanh nghiệp thương mại điện tử (TMĐT) là một trong những lĩnh vực được cơ quan thuế đặc biệt chú trọng kiểm tra. Cục Thuế đã thành lập Chi cục Thuế Thương mại điện tử chuyên phụ trách quản lý và kiểm tra đối tượng này. Các nền tảng TMĐT, đơn vị bán hàng online, người bán trên Shopee/Lazada/TikTok Shop... đều thuộc phạm vi quản lý và có thể bị kiểm tra thuế theo các trường hợp quy định tại khoản 3 Điều 22 Luật Quản lý thuế 2025 nếu có dấu hiệu vi phạm, được lựa chọn theo kế hoạch hoặc có tố cáo. Từ 01/07/2026, khuôn khổ pháp lý quản lý thuế TMĐT được hoàn thiện và chặt chẽ hơn.

Theo Luật Quản lý thuế 2025 và thực tiễn triển khai, cơ quan thuế sử dụng nguyên tắc quản lý rủi ro và các tiêu chí sau để lập kế hoạch kiểm tra hàng năm:
• Doanh nghiệp lỗ liên tiếp nhiều năm (đặc biệt lỗ 02 năm liên tiếp với doanh thu từ 1.000 tỷ đồng trở lên).
• Tỷ lệ nộp thuế TNDN thấp bất thường so với doanh thu và ngành nghề.
• Hoàn thuế GTGT nhiều nhưng chưa từng bị kiểm tra.
• Giao dịch liên kết lớn, biên lợi nhuận thấp.
• Doanh nghiệp chưa được kiểm tra trong nhiều năm.
• Có thông tin tố cáo, phản ánh về vi phạm thuế.
• Thuộc ngành nghề trọng điểm trong năm kế hoạch.
Dữ liệu phân tích được xây dựng trên Hệ thống thông tin quản lý thuế (TMS) kết hợp với thông tin từ các cơ quan khác.

Với việc Luật Quản lý thuế 2025 chính thức có hiệu lực từ 01/07/2026, IAM khuyến nghị doanh nghiệp thực hiện ngay các bước chuẩn bị sau:
1. Rà soát hồ sơ thuế 03-05 năm gần nhất: phát hiện sai sót và kê khai điều chỉnh trước khi bị kiểm tra.
2. Chuẩn hóa hệ thống kế toán và hóa đơn điện tử: đảm bảo dữ liệu đồng nhất, dễ truy xuất.
3. Rà soát giao dịch liên kết: cập nhật hồ sơ xác định giá theo Nghị định 132/2020/NĐ-CP.
4. Lưu trữ đầy đủ hồ sơ hoàn thuế tối thiểu 05 năm.
5. Đánh giá mức độ rủi ro thuế của doanh nghiệp theo các tiêu chí cơ quan thuế sử dụng.
6. Tham khảo dịch vụ tư vấn thuế chuyên nghiệp từ IAM để xây dựng kế hoạch quản lý rủi ro thuế chủ động và bài bản.

Quy trình kiểm tra thuế tại trụ sở người nộp thuế theo Luật Quản lý thuế 2025 gồm các bước chính:
Bước 1: Cơ quan thuế ban hành Quyết định kiểm tra và gửi cho người nộp thuế.
Bước 2: Công bố quyết định kiểm tra tại trụ sở người nộp thuế – thời hạn kiểm tra bắt đầu từ ngày này.
Bước 3: Đoàn kiểm tra tiến hành thu thập hồ sơ, tài liệu, chứng từ; yêu cầu giải trình và làm rõ các vấn đề phát sinh.
Bước 4: Lập Biên bản kiểm tra thuế – hai bên ký xác nhận (hoặc ghi ý kiến bảo lưu nếu không đồng ý).
Bước 5: Cơ quan thuế ban hành Kết luận kiểm tra và Quyết định xử lý (nếu có vi phạm) trong thời hạn quy định.
Bước 6: Người nộp thuế thực hiện quyết định xử lý hoặc khiếu nại nếu không đồng ý.

Các mức phạt áp dụng khi vi phạm thuế bị phát hiện qua kiểm tra tại trụ sở theo pháp luật hiện hành gồm:
• Phạt khai sai dẫn đến thiếu thuế: 10%-20% số thuế khai thiếu, cộng tiền chậm nộp 0,03%/ngày.
• Phạt trốn thuế: từ 1 đến 3 lần số thuế trốn tùy mức độ vi phạm và số lần tái phạm.
• Phạt không nộp hồ sơ khai thuế: từ 2 triệu đến 25 triệu đồng tùy số ngày chậm nộp.
• Phạt sử dụng hóa đơn bất hợp pháp: có thể bị truy cứu trách nhiệm hình sự nếu nghiêm trọng.
• Phạt vi phạm hành chính về hóa đơn: từ 4 triệu đến 50 triệu đồng tùy hành vi.
Ngoài phạt tiền, doanh nghiệp còn bị công khai thông tin vi phạm trên cổng thông tin điện tử của cơ quan thuế, ảnh hưởng đến uy tín kinh doanh.

Bản thân doanh nghiệp không có quyền yêu cầu cơ quan thuế kiểm tra trước hoàn thuế vì đây là quyết định của cơ quan thuế dựa trên phân loại rủi ro. Tuy nhiên, để được hoàn thuế nhanh, doanh nghiệp nên:
• Chuẩn bị hồ sơ hoàn thuế đầy đủ, chính xác, hợp lệ ngay từ đầu, tránh phải bổ sung nhiều lần.
• Đảm bảo hóa đơn đầu vào có giá trị khấu trừ hợp lệ theo quy định (giao dịch từ 5 triệu đồng phải thanh toán không dùng tiền mặt).
• Duy trì lịch sử tuân thủ thuế tốt để được xếp loại rủi ro thấp, từ đó có khả năng được hoàn thuế trước, kiểm tra sau.
• Tích cực phối hợp với cơ quan thuế trong quá trình xử lý hồ sơ hoàn thuế.
Doanh nghiệp tuân thủ tốt thường được ưu tiên xử lý nhanh hơn theo nguyên tắc quản lý rủi ro.

Việc nộp thuế điện tử là bắt buộc đối với hầu hết doanh nghiệp tại Việt Nam và không phải yếu tố giảm xác suất bị kiểm tra thuế. Tuy nhiên, doanh nghiệp sử dụng đầy đủ hóa đơn điện tử, kê khai điện tử và thanh toán không tiền mặt tạo ra chuỗi dữ liệu số minh bạch, giúp cơ quan thuế dễ đối chiếu và xác minh. Điều này có thể giúp doanh nghiệp:
• Giảm thời gian kiểm tra vì dữ liệu đã có sẵn, đồng nhất.
• Được phân loại rủi ro thấp hơn nếu số liệu nhất quán.
• Được xếp vào diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau thay vì phải kiểm tra trước hoàn thuế.
Sử dụng phần mềm kế toán tích hợp hóa đơn điện tử như IAM INVOICE là bước quan trọng để quản lý rủi ro thuế trong kỷ nguyên số hóa.